新疆生地所在植物抗逆分子育种候选基因研究方面获进展

　　AP2/ERF (APETALA2/ethylene-responsive factor)是一类重要的且广泛存在于植物中的转录因子超家族，是植物转录因子家族中成员最多的转录因子家族之一。AP2/ERF 超家族在植物响应生物、非生物胁迫和调控植物组织器官发育等过程中发挥着重要的作用，因此，该家族一直是植物抗逆分子育种的理想候选基因。 

　　中国科学院新疆生态与地理研究所张道远研究员团队，以沙漠耐干苔藓齿肋赤藓为研究材料，以齿肋赤藓转录组数据库为基础，通过生物信息学方法从齿肋赤藓中共鉴定出80个AP2/ERF家族基因。且基于AP2结构域个数、多序列比对、进化树分析和motif预测对80个基因进行明确的亚家族分类，结果表明齿肋赤藓的80个AP2/ERF基因包含5个AP2亚家族成员、72个ERF成员、1个RAV基因和2个Soloists基因。齿肋赤藓AP2/ERF家族各个亚家族成员基因所占的比列与模式藓类小立碗藓基本一致，但相对被子植物拟南芥来说，齿肋赤藓ERF亚家族成员出现明显扩张，相应的AP2和RAV亚家族家族数量变小。对研究最为透彻且抗逆通路中起主导作用的DREB亚家族的分析表明：从齿肋赤藓中鉴定出来的DREB亚家族成员大部分基因属于A-5类DREB，且不同DREB基因对苔藓植物特有的干旱复水过程的响应模式不同，大部分A-5类基因主要在复水阶段强烈诱导表达。 

　　该研究首次从苔藓植物中系统全面地对AP2/ERF超家族进行了鉴定和分类，不仅为日后齿肋赤藓中AP2/ERF家族基因的功能分析奠定了良好的基础，同时也为其它苔藓植物AP2/ERF超家族的分类提供了参考。 

　　相关结果以Transcriptome-Wide Identification, Classification and Characterization of AP2/ERF Family Genes in the Desert Moss Syntrichia caninervis发表于Frontiers in Plant Science期刊上。