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2017-03-27 | 编辑: | 【

  AP2/ERF (APETALA2/ethylene-responsive factor)是一类重要的且广泛存在于植物中的转录因子家族,是植物转录因子家族中成员最多的转录因子家族之一。AP2/ERF 超家族在植物响应生物、非生物胁迫和调控植物组织器官发育等过程中发挥着重要的作用,因此,该家族一直是植物抗逆分子育种的理想候选基因。 

  中国科学院新疆生态与地理研究所张道远研究员团队,以沙漠耐干苔藓齿肋赤藓为研究材料,以齿肋赤藓转录组数据库为基础,通过生物信息学方法从齿肋赤藓中共鉴定出80AP2/ERF家族基因。且基于AP2结构域个数、多序列比对、进化树分析和motif预测对80个基因进行明确的亚家族分类,结果表明齿肋赤藓的80AP2/ERF基因包含5AP2亚家族成员、72ERF成员、1RAV基因和2Soloists基因。齿肋赤藓AP2/ERF家族各个亚家族成员基因所占的比列与模式藓类小立碗藓基本一致,但相对被子植物拟南芥来说,齿肋赤藓ERF亚家族成员出现明显扩张,相应的AP2RAV亚家族家族数量变小。对研究最为透彻且抗逆通路中起主导作用的DREB亚家族的分析表明:从齿肋赤藓中鉴定出来的DREB亚家族成员大部分基因属于A-5DREB,且不同DREB基因对苔藓植物特有的干旱复水过程的响应模式不同,大部分A-5类基因主要在复水阶段强烈诱导表达。 

  该研究首次从苔藓植物中系统全面地对AP2/ERF超家族进行了鉴定和分类,不仅为日后齿肋赤藓中AP2/ERF家族基因的功能分析奠定了良好的基础,同时也为其它苔藓植物AP2/ERF超家族的分类提供了参考。 

  相关结果以Transcriptome-Wide Identification, Classification and Characterization of AP2/ERF Family Genes in the Desert Moss Syntrichia caninervis发表于Frontiers in Plant Science期刊上 

 
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